子宫是个外形像倒梨形的空腔器官，在没有胎儿居住的时候，像没有充气的气球。子宫内膜异位症（内异症）是指原本属于子宫腔的内膜组织，跑到子宫腔以外的地方，并在异位种植生长，具有活力。它们可能散落在盆、腹腔各脏器表面或腹膜表面；如果长在卵巢，则俗称为卵巢巧克力囊肿；如长在子宫肌层内，则称为子宫肌腺症。
这些异位的内膜组织，也会随着月经周期而发生周期性的变化，经期会剥脱出血，进而伤害到周围的组织。只要卵巢组织具有功能，分泌激素，该病就逐渐加重。因此，粘在卵巢、盆腹腔腹膜表面、甚至肠表面的内膜组织，到了生理期也会剥落出血，但这些出血不像宫内的经血可以顺著宫颈排出，它们被积聚在体内，不断地累积形成病灶。这些病灶会侵蚀周围的组织器官，进而出现相应的症状：如果在肠道附近，就容易导致腹泻、便血；如果是在卵巢，就可能会影响卵巢和输卵管的功能，造成不孕，下腹痛，痛经等；在盆腔的病灶也可能会造成盆腔的粘连，导致患者的慢性盆腔痛或是性交痛等。
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